Kėdainių „Nevėžis“ įkurtas 1962 metais ir yra vienas senas tradicijas turinčių Lietuvos futbolo klubų. Jo istorijos aukso laikotarpiu laikomi 1966–1973 metai. Sovietinės Lietuvos čempionatą komanda laimėjo 1966, 1972 ir 1973 metais, taip pat ne kartą iškovojo to meto šalies taurę.

Atkūrus Lietuvos nepriklausomybę „Nevėžis“ rungtyniavo skirtingose nacionalinių pirmenybių pakopose. 1997 metais komanda sugrįžo į aukščiausiąją lygą, o 2001 metais pasiekė LFF taurės pusfinalį. Vėlesniame klubo kelyje svarbi vieta teko Pirmos lygos varžyboms ir Kėdainiuose užaugintų futbolininkų rengimui.